בעת שימוש במבחנות זכוכית במסגרת מעבדה, חיוני להקפיד על סדרה של נהלים ואמצעי זהירות מרכזיים. בראש ובראשונה, לפני ואחרי השימוש, יש לוודא שהמבחנה נקייה וללא שאריות על ידי שטיפה יסודית עם חומר ניקוי, מים או אלכוהול; בנוסף, בדוק בקפידה את הצינור עבור סדקים או פגמים כדי למנוע כשל ניסוי או סכנות בטיחותיות. יתר על כן, המבחנה חייבת להישמר יבשה, הן מבפנים והן מבחוץ, כדי למנוע הפרעה של לחות עם תוצאות הניסוי. במהלך הפעולות, החימום צריך להתבצע בהדרגה כדי למנוע עליות טמפרטורה מהירות שעלולות לגרום לניפוץ הצינור; באופן דומה, בעת ניעור הצינור, טפל בו בעדינות כדי למנוע התזת תוכן הנוזל.
יתר על כן, יש להגן על מבחנות מפני פגיעה בחפצים קשים. בעת העברת נוזלים, היזהר על ידי הטיית הצינור כדי למנוע שפיכה, והישמר בקפדנות מפני זיהום- צולב. לאחסון, יש למקם את המבחנות בצורה מאובטחת כדי למנוע התנגשות בשוגג ולסומן בבירור כדי למנוע התערבבות. מבחנות המכילות גזים דורשות שחרור קל של הפקק כדי למנוע שבירה הנגרמת על ידי תנודות לחץ; בנוסף, לאחסון-לטווח ארוך, יש להגביל אותם כדי להגן מפני אבק ולהבטיח את המשך הניקיון של המשטחים הפנימיים והחיצוניים כאחד. הקפדה על הנחיות מקצועיות אלו תשפר משמעותית הן את הבטיחות והן את הדיוק של ניסויי מעבדה.