דרישות האחסון לפיפטות פסטר נקבעות בעיקר על פי הרכב החומרים שלהן (פלסטיק חד פעמי או זכוכית) והאם הן עברו סטריליזציה. על פי המידע העדכני ביותר הזמין לציבור, דרישות האחסון עבור פיפטות פסטר חד פעמיות מפלסטיק הן כדלקמן:
תנאי אחסון
טמפרטורה וסביבה: הובלה בטמפרטורת הסביבה; אחסן בטמפרטורת החדר, הימנעות מחשיפה לחום או לחות גבוהים.
חשיפה לאור: יש לשמור במקום קריר וחשוך כדי למנוע מקרינה אולטרה סגולה או אור עז לפגוע ביציבות החומר.
דרישות סטריליות: אם המוצר עבר עיקור (למשל באמצעות הקרנת גמא), מומלץ לאחסן אותו בסביבה סטרילית כדי לשמור על מצבו האספטי ולמנוע זיהום.
חיי מדף: בדרך כלל 3 שנים; עם זאת, אורך החיים בפועל מושפע מתנאי האחסון, ויש להשתמש במוצר בתוך תקופת התפוגה המוצהרת שלו.